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陈鹏课题组主要结合化学生物学、分析化学、基因组学、合成生物学、药学等多学科交叉手段探究人体和海洋微生物相关代谢产物介导的“微生物-微生物”、“微生物-宿主”、“微生物-环境”互作，从基因和化学分子水平解析并调控生命的互作活动，为活菌药物、微生物组药物、和“新一代”小分子药物的开发奠定基础。